Podcast sciences. Du génome au protéome, l’immense défi de Charles Pineau

Charles Pineau

Dans « Voyages extraordinaires dans le monde des sciences », une émission Radio Laser créée en partenariat avec Unidivers, nous avions reçu Charline Waremberg, chercheuse Inserm à l’Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset, Rennes) travaillant sur la cohorte Pélagie concernant les mères et les enfants de Bretagne. Cette fois, nous accueillons Charles Pineau, directeur de recherche Inserm, lui aussi à l’Irset.

Charles Pineau nous explique son parcours, comment il s’est passionné un jour pour la biologie, domaine qu’il n’aura jamais quitté ensuite, l’importance qu’a eu son séjour postdoctoral de 3 ans à Rockefeller University, New York. Convaincu de l’importance des technologies de protéomique et de protéomique intégrative, il les applique pour répondre à des problèmes biologiques et cliniques clés dans le domaine de la physiopathologie testiculaire et de la toxicologie de la reproduction. Nous parlons avec lui de son équipe COCOON, de la plate-forme Protim, de Biosit mais aussi et surtout de l’immense défi lancé par le Human Proteome Project (HPP), un projet international d’une envergure et d’une ambition plus grandes encore que celles du Human Genome project, et dont il vient de quitter la présidence après 4 ans de mandat.

charles pineau génome protéome

Comprendre les complexités du protéome dans le contexte d’un organisme humain et ses nombreux états potentiels est une condition nécessaire à la compréhension de la biologie humaine, mais ces complexités ne peuvent pas être prédites à partir du seul génome. Les progrès récents des technologie protéomiques et des sciences de traitement de l’information offrent désormais la possibilité d’étudier la biologie complexe du corps humain à une résolution et une échelle sans précédent. Pour réussir une telle entreprise, il fallait créer un cadre international pour la collaboration mondiale, le partage des données, l’assurance qualité et l’amélioration de l’annotation précise du protéome codé par le génome humain.

C’est en 2010 qu’a été lancé le Human Proteome Project (HPP) par la Human Proteome Organization (HUPO). Ce projet mondial, associant des équipes de recherche multidisciplinaires du monde entier issues des secteurs universitaire, industriel et gouvernemental, a été rejoint tout dernièrement par le π-HuB project (proteomic navigator of the human body) à l’initiative de la Chine. Charles Pineau nous dira que les enjeux sont tels pour la compréhension des mécanismes pathologiques et les traitements à venir que des investissements massifs sont engagés aux USA et en Chine, des efforts que l’Europe et la France sont incapables de suivre pour l’instant.

Pour aller plus loin :

Site de l’Irset, Institut de recherche en santé, environnement et travail
Site de l’HUPO, Human Proteome Organization

Lectures pour comprendre le génome :

The selfish gene, Richard Dawkins – Oxford University Press, 4th edition 
Néandertal : à la recherche des génomes perdus, (trad. de l’anglais), Paris, Eds Les Liens qui libèrent
L’éclipse du savoir de Lindsay Waters, ALLIA Petite collection edition

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Jean-Louis Coatrieux
Jean-Louis Coatrieux est spécialiste de l’imagerie numérique médicale, écrivain et essayiste. Il a publié de nombreux ouvrages, notamment aux éditions La Part Commune et Riveneuve éditions.

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